Karena ketidaksengajaan dewa, seorang remaja bernama Touya tak sengaja terbunuh karena insiden tersebut. Saat ini dia terbangun di sebuah tempat asing bersama dewa itu.

Dewa tersebut memberitahukan Touya bahwa ia akan menghidupkannya kembali di dunia yang berbeda, yakni dunia yang dipenuhi dengan sihir dan akan menjadi kehidupan baru Touya.

Sebagai permintaan maaf, Touya diberikan satu permintaan apapun itu. Touya akhirnya memilih untuk dapat menggunakan smartphonenya di dunia barunya kelak, dewa tersebut mengabulkan permintaannya, bahkan ia memberi Touya kemampuan lebih kepada tubuh serta pengetahuan Touya agar dapat berguna di dunianya yang baru.

Sesampainya di dunia tersebut, Touya menyadari ia dapat menggunakan berbagai macam ilmu sihir dengan mudah, serta kekuatan dan pergerakannya yang meningkat pesat. Touya juga bertemu dengan gadis kembar Linze Silhoueska & Elze Silhoueska.

Bagaimanakah kisah Touya selanjutnya? petualangan apakah yang menanti mereka?

Tonton juga kelanjutannya, Isekai wa Smartphone to Tomo ni. Season 2